TREM1

TREM1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1Q8M, 1SMO

Идентификаторы
ПсевдонимыTREM1, CD354, TREM-1, triggering receptor expressed on myeloid cells 1
Внешние IDOMIM: 605085 MGI: 1930005 HomoloGene: 10243 GeneCards: TREM1
Расположение гена (человек)
6-я хромосома человека
Хр.6-я хромосома человека[1]
6-я хромосома человека
Расположение в геноме TREM1
Расположение в геноме TREM1
Локус6p21.1Начало41,267,926 bp[1]
Конец41,286,682 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
17-я хромосома мыши
Хр.17-я хромосома мыши[2]
17-я хромосома мыши
Расположение в геноме TREM1
Расположение в геноме TREM1
Локус17|17 CНачало48,539,796 bp[2]
Конец48,553,952 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • upper lobe of left lung

  • lower lobe of lung
Наибольшая экспрессия в
  • secondary oocyte
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • scaffold protein binding
  • signaling receptor activity
Компонент клетки
  • часть мембраны
  • мембрана
  • клеточная мембрана
  • внеклеточная область
  • внутренний компонент клетки
Биологический процесс
  • intracellular signal transduction
  • humoral immune response
  • regulation of immune response
  • врождённый иммунитет
  • leukocyte migration
  • acute inflammatory response
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

54210

58217

Ensembl

ENSG00000124731

ENSMUSG00000042265

UniProt

Q9NP99

Q9JKE2

RefSeq (мРНК)

NM_001242589
NM_001242590
NM_018643

NM_021406
NM_001347399

RefSeq (белок)

NP_001229518
NP_001229519
NP_061113

NP_001334328
NP_067381

Локус (UCSC)Chr 6: 41.27 – 41.29 MbChr 17: 48.54 – 48.55 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

TREM1 (англ. Triggering receptor expressed on myeloid cells 1; CD354) — клеточный рецептор, продукт гена человека TREM1[5]

Функции

TREM1 стимулирует воспалительную реакцию, опосредованную моноцитами, макрофагами и нейтрофилами, и приводить к выбросу провоспалительных хемокинов и цитокинов[6][7]. Воспалительная реакция также может стимулироваться рядом рецепторов, включая рецепторы, сопряжённые с G-белком (например, FPR1), Fc-рецепторы, CD14, толл-подобные рецепторы (в первую очередь TLR4) и рецепторами к цитокинам (например, IFNGR1). Активация этих рецепторов также может сенсибилизировать миелоидные клетки к ответу на другие раздражители. Миелоидные клетки экспрессируют рецепторы иммуноглобулинового суперсемейства, такие как TREM1, которые могут нести как активирующую (KIR2DS1), так и ингибирующую KIR2DL1) функцию[5].

В гранумоцитарных клетках TREM1 активируется C/EBPε независимо от воспалительной реакции[8].

Тканевая локализация

Высокий уровень экспрессии обнаружен во печени, лёгких и селезёнке взрослого организма, но не в соответствующих тканях плода. Также экспрессируется в лимфатическом узле, плаценте, спинном мозге и сердце. Экспрессия более выражена в лейкоцитах периферической крови, чем в костном мозге и в нормальных клетках, чем в злокачественных клетках. Экспрессирован с низким уровнем на начальном этапе развития кроветворной системы и в промоноцитарной стадии и на высоких уровнях в зрелых моноцитах. Экспрессия значительно повышается при острых воспалительных поражениях, вызванных бактериями и грибками. Растворимая изоформа 2 была обнаружена в лёгких, печени и зрелых моноцитах[6][9].

Взаимодействия

Взаимодействует с цитозольным адаптерным белком TYROBP[6][10].

Структура

Имеет один иммуноглобулино-подобный домена типа V. Включает 234 аминокислоты, молекулярная масса 26,4 кДа. Альтернативный сплайсинг приводит к образованию 3 изоформ. Самая короткая изоформа 2 (150 аминокислот, 17,6 кДа) не содержит мембранного домена и может секретироваться.

Литература

  • Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides (англ.) // Gene[англ.] : journal. — Elsevier, 1994. — January (vol. 138, no. 1—2). — P. 171—174. — doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. — PMID 8125298.
  • Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K., Suyama A., Sugano S. Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library (англ.) // Gene[англ.] : journal. — Elsevier, 1997. — October (vol. 200, no. 1—2). — P. 149—156. — doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. — PMID 9373149.
  • Bouchon A., Facchetti F., Weigand M. A., Colonna M. TREM-1 amplifies inflammation and is a crucial mediator of septic shock (англ.) // Nature : journal. — 2001. — April (vol. 410, no. 6832). — P. 1103—1107. — doi:10.1038/35074114. — PMID 11323674.
  • Allcock R. J., Barrow A. D., Forbes S., Beck S., Trowsdale J. The human TREM gene cluster at 6p21.1 encodes both activating and inhibitory single IgV domain receptors and includes NKp44 (англ.) // European Journal of Immunology[англ.] : journal. — 2003. — February (vol. 33, no. 2). — P. 567—577. — doi:10.1002/immu.200310033. — PMID 12645956.
  • Bleharski J. R., Kiessler V., Buonsanti C., Sieling P. A., Stenger S., Colonna M., Modlin R. L. A role for triggering receptor expressed on myeloid cells-1 in host defense during the early-induced and adaptive phases of the immune response (англ.) // Journal of Immunology[англ.] : journal. — 2003. — April (vol. 170, no. 7). — P. 3812—3818. — doi:10.4049/jimmunol.170.7.3812. — PMID 12646648.
  • Colonna M., Facchetti F. TREM-1 (triggering receptor expressed on myeloid cells): a new player in acute inflammatory responses (англ.) // The Journal of Infectious Diseases : journal. — 2003. — June (vol. 187 Suppl 2). — P. S397—401. — doi:10.1086/374754. — PMID 12792857.
  • Radaev S., Kattah M., Rostro B., Colonna M., Sun P. D. Crystal structure of the human myeloid cell activating receptor TREM-1 (англ.) // Structure : journal. — 2003. — December (vol. 11, no. 12). — P. 1527—1535. — doi:10.1016/j.str.2003.11.001. — PMID 14656437.
  • Radsak M. P., Salih H. R., Rammensee H. G., Schild H. Triggering receptor expressed on myeloid cells-1 in neutrophil inflammatory responses: differential regulation of activation and survival (англ.) // Journal of Immunology[англ.] : journal. — 2004. — April (vol. 172, no. 8). — P. 4956—4963. — doi:10.4049/jimmunol.172.8.4956. — PMID 15067076.
  • Wang D. Y., Qin R. Y., Liu Z. R., Gupta M. K., Chang Q. Expression of TREM-1 mRNA in acute pancreatitis (англ.) // World Journal of Gastroenterology[англ.] : journal. — 2004. — September (vol. 10, no. 18). — P. 2744—2746. — doi:10.3748/wjg.v10.i18.2744. — PMID 15309732. — PMC 4572206.
  • Kelker M. S., Foss T. R., Peti W., Teyton L., Kelly J. W., Wüthrich K., Wilson I. A. Crystal structure of human triggering receptor expressed on myeloid cells 1 (TREM-1) at 1.47 A (англ.) // Journal of Molecular Biology[англ.] : journal. — 2004. — September (vol. 342, no. 4). — P. 1237—1248. — doi:10.1016/j.jmb.2004.07.089. — PMID 15351648.
  • Knapp S., Gibot S., de Vos A., Versteeg H. H., Colonna M., van der Poll T. Cutting edge: expression patterns of surface and soluble triggering receptor expressed on myeloid cells-1 in human endotoxemia (англ.) // Journal of Immunology[англ.] : journal. — 2004. — December (vol. 173, no. 12). — P. 7131—7134. — doi:10.4049/jimmunol.173.12.7131. — PMID 15585833.
  • González-Roldán N., Ferat-Osorio E., Aduna-Vicente R., Wong-Baeza I., Esquivel-Callejas N., Astudillo-de la Vega H., Sánchez-Fernández P., Arriaga-Pizano L., Villasís-Keever M. A., López-Macías C., Isibasi A. Expression of triggering receptor on myeloid cell 1 and histocompatibility complex molecules in sepsis and major abdominal surgery (англ.) // World Journal of Gastroenterology[англ.] : journal. — 2005. — December (vol. 11, no. 47). — P. 7473—7479. — doi:10.3748/wjg.v11.i47.7473. — PMID 16437719. — PMC 4723392.
  • Tzivras M., Koussoulas V., Giamarellos-Bourboulis E. J., Tzivras D., Tsaganos T., Koutoukas P., Giamarellou H., Archimandritis A. Role of soluble triggering receptor expressed on myeloid cells in inflammatory bowel disease (англ.) // World Journal of Gastroenterology[англ.] : journal. — 2006. — June (vol. 12, no. 21). — P. 3416—3419. — doi:10.3748/wjg.v12.i21.3416. — PMID 16733861. — PMC 4087875.
  • Plachouras D., Routsi C., Giamarellos-Bourboulis E. J., Spyridaki E., Andrianakis I., Metzelopoulos S., Tsaganos T., Floros I., Douzinas E. E., Armaganidis A., Roussos C., Giamarellou H. Monocytes as a site of production of soluble triggering receptor expressed on myeloid cells-1 (sTREM-1) in the septic host (англ.) // Scandinavian Journal of Infectious Diseases[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 38, no. 10. — P. 909—915. — doi:10.1080/00365540600786523. — PMID 17008237.
  • Murakami Y., Kohsaka H., Kitasato H., Akahoshi T. Lipopolysaccharide-induced up-regulation of triggering receptor expressed on myeloid cells-1 expression on macrophages is regulated by endogenous prostaglandin E2 (англ.) // Journal of Immunology[англ.] : journal. — 2007. — January (vol. 178, no. 2). — P. 1144—1150. — doi:10.4049/jimmunol.178.2.1144. — PMID 17202378.

Примечания

  1. ↑ 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000124731 - Ensembl, May 2017
  2. ↑ 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000042265 - Ensembl, May 2017
  3. ↑ Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ↑ Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ↑ 1 2 Entrez Gene: TREM1 triggering receptor expressed on myeloid cells 1  (неопр.).
  6. ↑ 1 2 3 Bouchon A., Dietrich J., Colonna M. Cutting edge: inflammatory responses can be triggered by TREM-1, a novel receptor expressed on neutrophils and monocytes. (англ.) // J Immunol[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 164, no. 10. — P. 4991—4995. — doi:10.4049/jimmunol.164.10.4991. — PMID 10799849.
  7. ↑ Bouchon A., Facchetti F., Weigand M. A., Colonna M. TREM-1 amplifies inflammation and is a crucial mediator of septic shock. (англ.) // Nature : journal. — 2001. — Vol. 410, no. 6832. — P. 1103—1107. — doi:10.1038/35074114. — PMID 11323674.
  8. ↑ Suh H. C., Benoukraf T, Shyamsunder P., Yin T., Cao Q., Said J., Lee S., Lim R., Yang H., Salotti J., Johnson P. F., Madan V., Koeffler H. P. LPS independent activation of the pro-inflammatory receptor Trem1 by C/EBPε in granulocytes (англ.) // Scientific Reports[англ.] : journal. — 2017. — April (vol. 7). — P. 46440. — doi:10.1038/srep46440. — PMID 28440307. — PMC 5404328.
  9. ↑ Gingras M. C., Lapillonne H., Margolin J. F. TREM-1, MDL-1, and DAP12 expression is associated with a mature stage of myeloid development. (англ.) // Mol Immunol[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 38, no. 11. — P. 817—824. — PMID 11922939.
  10. ↑ Kelker M. S., Foss T. R., Peti W., Teyton L., Kelly J. W., Wüthrich K et al. Crystal structure of human triggering receptor expressed on myeloid cells 1 (TREM-1) at 1.47 A. (англ.) // J Mol Biol[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 342, no. 4. — P. 1237—1248. — doi:10.1016/j.jmb.2004.07.089. — PMID 15351648.
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400