CLEC4M

CLEC4M
Доступные структуры PDB Поиск ортологов: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 1K9J, 1SL6, 1XAR, 1XPH, 3JQH
Идентификаторы
Псевдонимы	CLEC4M, CD209L, CD299, DC-SIGN2, DC-SIGNR, DCSIGNR, HP10347, L-SIGN, LSIGN, C-type lectin domain family 4 member M
Внешние ID	OMIM: 605872 MGI: 2157942 HomoloGene: 129771 GeneCards: CLEC4M
Расположение гена (человек) Хр. 19-я хромосома человека[1] Локус 19p13.2 Начало 7,763,210 bp[1] Конец 7,769,605 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 8-я хромосома мыши[2] Локус 8|8 A1.1 Начало 3,793,397 bp[2] Конец 3,798,984 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в right lobe of liver germinal epithelium pancreatic ductal cell upper lobe of left lung Наибольшая экспрессия в skin of abdomen right lung lobe subcutaneous adipose tissue Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция peptide antigen binding virus receptor activity связывание с ионом металла calcium-dependent protein binding mannose binding virion binding ICAM-3 receptor activity связывание углеводов signaling receptor activity связывание с белками плазмы Компонент клетки цитоплазма часть мембраны мембрана клеточная мембрана часть клеточной мембраны внеклеточная область host cell Биологический процесс leukocyte cell-cell adhesion cell-cell recognition внутриклеточный перенос вируса intracellular signal transduction antigen processing and presentation эндоцитоз adaptive immune response immune system process viral genome replication peptide antigen transport modulation by virus of host process врождённый иммунитет вирусный процесс virion attachment to host cell viral entry into host cell Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 10332 170786 Ensembl ENSG00000104938 ENSMUSG00000031494 UniProt Q9H2X3 Q91ZX1 RefSeq (мРНК) NM_001144904 NM_001144905 NM_001144906 NM_001144907 NM_001144908 NM_001144909 NM_001144910 NM_001144911 NM_014257 NM_214675 NM_214676 NM_133238 RefSeq (белок) NP_001138376 NP_001138377 NP_001138378 NP_001138379 NP_001138380 NP_001138381 NP_001138382 NP_001138383 NP_055072 NP_573501 Локус (UCSC) Chr 19: 7.76 – 7.77 Mb Chr 8: 3.79 – 3.8 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

CLEC4M (англ. C-type lectin domain family 4 member M, лектин С-типа домен семейство 4 член M; CD299), или L-SIGN, — мембранный белок, лектин типа С. Продукт гена человека CLEC4M^[5].

Функции

Белок является мембранным белком 2-го типа. На 77% гомологичен белку CD209. Оба белка связывают белок клеточной адгезии ICAM-3 и вирусный белок HIV-1 gp120. Взаимодействие с HIV-1 gp120 повышает инфекцию вирусом T-лимфоцитов. Обнаружены множественные варианты белка из-за альтернативного сплайсинга. Ген CLEC4M находится на 19p13.3 в кластере с CD209 и CD23/FCER2^[6].

Относится к рецепторам опознавания паттерна, участвует в периферийном иммунном ответе в печени. Может опосредовать эндоцитоз патогенов, ведущего к последующей деградации патогена в лизосомах. Рецептор ICAM3 и, возможно, маннозо-подобных углеводов.

Примечания

Литература

• Baribaud F., Doms R.W., Pöhlmann S. The role of DC-SIGN and DC-SIGNR in HIV and Ebola virus infection: can potential therapeutics block virus transmission and dissemination? (англ.) // Expert Opin. Ther. Targets^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 6, no. 4. — P. 423—431. — doi:10.1517/14728222.6.4.423. — PMID 12223058.
• Becker Y. HIV-1 gp120 binding to dendritic cell receptors mobilize the virus to the lymph nodes, but the induced IL-4 synthesis by FcepsilonRI+ hematopoietic cells damages the adaptive immunity--a review, hypothesis, and implications. (англ.) // Virus Genes : journal. — 2004. — Vol. 29, no. 1. — P. 147—165. — doi:10.1023/B:VIRU.0000032797.43537.d3. — PMID 15215692.
• Lalor P.F., Lai W.K., Curbishley S.M. et al. Human hepatic sinusoidal endothelial cells can be distinguished by expression of phenotypic markers related to their specialised functions in vivo. (англ.) // World J. Gastroenterol.^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 12, no. 34. — P. 5429—5439. — doi:10.3748/wjg.v12.i34.5429. — PMID 17006978.
• Curtis B.M., Scharnowske S., Watson A.J. Sequence and expression of a membrane-associated C-type lectin that exhibits CD4-independent binding of human immunodeficiency virus envelope glycoprotein gp120. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 1992. — Vol. 89, no. 17. — P. 8356—8360. — doi:10.1073/pnas.89.17.8356. — PMID 1518869. — PMC 49917.
• Gattegno L., Ramdani A., Jouault T. et al. Lectin-carbohydrate interactions and infectivity of human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1). (англ.) // AIDS Res. Hum. Retroviruses^[англ.] : journal. — 1992. — Vol. 8, no. 1. — P. 27—37. — doi:10.1089/aid.1992.8.27. — PMID 1736938.
• Soilleux E.J., Barten R., Trowsdale J. DC-SIGN; a related gene, DC-SIGNR; and CD23 form a cluster on 19p13. (англ.) // J. Immunol.^[англ.] : journal. — 2000. — Vol. 165, no. 6. — P. 2937—2942. — doi:10.4049/jimmunol.165.6.2937. — PMID 10975799.
• Pöhlmann S., Soilleux E.J., Baribaud F. et al. DC-SIGNR, a DC-SIGN homologue expressed in endothelial cells, binds to human and simian immunodeficiency viruses and activates infection in trans. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2001. — Vol. 98, no. 5. — P. 2670—2675. — doi:10.1073/pnas.051631398. — PMID 11226297. — PMC 30196.
• Bashirova A.A., Geijtenbeek T.B., van Duijnhoven G.C. et al. A dendritic cell-specific intercellular adhesion molecule 3-grabbing nonintegrin (DC-SIGN)-related protein is highly expressed on human liver sinusoidal endothelial cells and promotes HIV-1 infection. (англ.) // Journal of Experimental Medicine^[англ.] : journal. — Rockefeller University Press^[англ.], 2001. — Vol. 193, no. 6. — P. 671—678. — doi:10.1084/jem.193.6.671. — PMID 11257134. — PMC 2193415.
• Mummidi S., Catano G., Lam L. et al. Extensive repertoire of membrane-bound and soluble dendritic cell-specific ICAM-3-grabbing nonintegrin 1 (DC-SIGN1) and DC-SIGN2 isoforms. Inter-individual variation in expression of DC-SIGN transcripts. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 35. — P. 33196—33212. — doi:10.1074/jbc.M009807200. — PMID 11337487.
• Mitchell D.A., Fadden A.J., Drickamer K. A novel mechanism of carbohydrate recognition by the C-type lectins DC-SIGN and DC-SIGNR. Subunit organization and binding to multivalent ligands. (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2001. — Vol. 276, no. 31. — P. 28939—28945. — doi:10.1074/jbc.M104565200. — PMID 11384997.
• Feinberg H., Mitchell D.A., Drickamer K., Weis W.I. Structural basis for selective recognition of oligosaccharides by DC-SIGN and DC-SIGNR. (англ.) // Science : journal. — 2002. — Vol. 294, no. 5549. — P. 2163—2166. — doi:10.1126/science.1066371. — PMID 11739956.
• Alvarez C.P., Lasala F., Carrillo J. et al. C-type lectins DC-SIGN and L-SIGN mediate cellular entry by Ebola virus in cis and in trans. (англ.) // J. Virol.^[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 76, no. 13. — P. 6841—6844. — doi:10.1128/JVI.76.13.6841-6844.2002. — PMID 12050398. — PMC 136246.
• Soilleux E.J., Morris L.S., Rushbrook S. et al. Expression of human immunodeficiency virus (HIV)-binding lectin DC-SIGNR: Consequences for HIV infection and immunity. (англ.) // Hum. Pathol.^[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 33, no. 6. — P. 652—659. — doi:10.1053/hupa.2002.124036. — PMID 12152166.
• Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences. (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
• Lin G., Simmons G., Pöhlmann S. et al. Differential N-linked glycosylation of human immunodeficiency virus and Ebola virus envelope glycoproteins modulates interactions with DC-SIGN and DC-SIGNR. (англ.) // J. Virol.^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 77, no. 2. — P. 1337—1346. — doi:10.1128/JVI.77.2.1337-1346.2003. — PMID 12502850. — PMC 140807.
• Pöhlmann S., Zhang J., Baribaud F. et al. Hepatitis C virus glycoproteins interact with DC-SIGN and DC-SIGNR. (англ.) // J. Virol.^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 77, no. 7. — P. 4070—4080. — doi:10.1128/JVI.77.7.4070-4080.2003. — PMID 12634366. — PMC 150620.
• Ota T., Suzuki Y., Nishikawa T. et al. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs. (англ.) // Nat. Genet. : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
• Engering A., van Vliet S.J., Hebeda K. et al. Dynamic populations of dendritic cell-specific ICAM-3 grabbing nonintegrin-positive immature dendritic cells and liver/lymph node-specific ICAM-3 grabbing nonintegrin-positive endothelial cells in the outer zones of the paracortex of human lymph nodes. (англ.) // Am. J. Pathol.^[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 164, no. 5. — P. 1587—1595. — doi:10.1016/S0002-9440(10)63717-0. — PMID 15111305. — PMC 1615649.