KDR

KDR
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1VR2, 1Y6A, 1Y6B, 1YWN, 2M59, 2MET, 2MEU, 2OH4, 2P2H, 2P2I, 2QU5, 2QU6, 2RL5, 2X1W, 2X1X, 2XIR, 3B8Q, 3B8R, 3BE2, 3C7Q, 3CJF, 3CJG, 3CP9, 3CPB, 3CPC, 3DTW, 3EFL, 3EWH, 3KVQ, 3S35, 3S36, 3S37, 3U6J, 3VHE, 3VHK, 3VID, 3VNT, 3VO3, 3WZD, 3WZE, 4AG8, 4AGC, 4AGD, 4ASD, 4ASE, 5EW3

Идентификаторы
ПсевдонимыKDR, CD309, FLK1, VEGFR, VEGFR2, Kinase insert domain receptor
Внешние IDOMIM: 191306 MGI: 96683 HomoloGene: 55639 GeneCards: KDR
Расположение гена (человек)
4-я хромосома человека
Хр.4-я хромосома человека[1]
4-я хромосома человека
Расположение в геноме KDR
Расположение в геноме KDR
Локус4q12Начало55,078,481 bp[1]
Конец55,125,595 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
5-я хромосома мыши
Хр.5-я хромосома мыши[2]
5-я хромосома мыши
Расположение в геноме KDR
Расположение в геноме KDR
Локус5 C3.3|5 40.23 cMНачало76,093,487 bp[2]
Конец76,139,118 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
  • germinal epithelium

  • lower lobe of lung

  • parietal pleura

  • right lobe of thyroid gland

  • left lobe of thyroid gland

  • upper lobe of lung

  • visceral pleura

  • upper lobe of left lung
Наибольшая экспрессия в
  • left lung lobe

  • right lung lobe

  • ankle joint

  • cardiac muscles

  • vascular endothelium

  • utricle
Дополнительные справочные данные
BioGPS
Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
  • трансферазная активность
  • Hsp90 protein binding
  • нуклеотид-связывающий
  • protein kinase activity
  • growth factor binding
  • vascular endothelial growth factor binding
  • kinase activity
  • integrin binding
  • связывание с белками плазмы
  • АТФ-связанные
  • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity
  • vascular endothelial growth factor-activated receptor activity
  • protein tyrosine kinase activity
  • связывание похожих белков
  • Рецепторные тирозинкиназы
  • transmembrane signaling receptor activity
  • cadherin binding
Компонент клетки
  • цитоплазма
  • часть мембраны
  • аппарат Гольджи
  • мембрана
  • часть клеточной мембраны
  • внеклеточная область
  • межклеточные контакты
  • early endosome
  • липидный рафт
  • sorting endosome
  • цитоплазматическая везикула
  • клеточное ядро
  • эндосома
  • клеточная мембрана
  • эндоплазматический ретикулум
  • receptor complex
Биологический процесс
  • negative regulation of endothelial cell apoptotic process
  • дифференцировка клеток
  • positive regulation of protein phosphorylation
  • positive regulation of mitochondrial fission
  • positive regulation of endothelial cell proliferation
  • фосфорилирование
  • extracellular matrix organization
  • негативная регуляция апоптоза
  • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process
  • cell migration involved in sprouting angiogenesis
  • positive regulation of angiogenesis
  • васкулогенез
  • positive regulation of endothelial cell migration
  • multicellular organism development
  • фосфорилация белка
  • positive regulation of macroautophagy
  • positive regulation of mitochondrial depolarization
  • positive regulation of vasculogenesis
  • embryonic hemopoiesis
  • endothelium development
  • regulation of cell shape
  • positive regulation of endothelial cell chemotaxis by VEGF-activated vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway
  • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade
  • peptidyl-tyrosine autophosphorylation
  • protein autophosphorylation
  • positive regulation of focal adhesion assembly
  • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling
  • peptidyl-tyrosine phosphorylation
  • cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus
  • вирусный процесс
  • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source
  • positive regulation of MAPK cascade
  • positive regulation of positive chemotaxis
  • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway
  • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway
  • позитивная регуляция пролиферации клеток
  • Ангиогенез
  • positive regulation of cell migration
  • protein kinase B signaling
  • ERK1 and ERK2 cascade
  • negative regulation of gene expression
  • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration
  • cellular response to hydrogen sulfide
  • positive regulation of cell migration involved in sprouting angiogenesis
  • negative regulation of signal transduction
  • sprouting angiogenesis
  • миграция клеток
  • endothelial cell differentiation
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez

3791

16542

Ensembl

ENSG00000128052

ENSMUSG00000062960

UniProt

P35968

P35918
Q8VCD0

RefSeq (мРНК)

NM_002253

NM_010612
NM_001363216

RefSeq (белок)

NP_002244

NP_034742
NP_001350145

Локус (UCSC)Chr 4: 55.08 – 55.13 MbChr 5: 76.09 – 76.14 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

KDR (англ. Kinase insert domain receptor, CD309), или Рецептор фактора роста сосудистого эндотелия, тип 2 (англ. vascular endothelial growth factor receptor 2, VEGFR-2), — белок тирозинкиназа, рецептор фактора роста VEGF, продукт гена человека KDR.

Функции

Протеинкиназа VEGFR-2 действует как рецептор для факторов роста VEGFA, VEGFC и VEGFD. Играет важную роль в регуляции ангиогенеза, сосудистого развития, проницаемости сосудов и эмбрионального гематопоэза. Повышает пролиферацию, выживаемость, миграцию и дифференцировку эндотелиальных клеток. Приводит к реорганизации актинового цитоскелета клетки. Изоформы 2 и 3, у которых отсутствует трансмембранный домен, могут действовать как ингибирующие рецепторы для факторов роста VEGFA, VEGFC и VEGFD. Изоформа 2 действует как отрицательный регулятор лимфангиогенеза, опосредованного VEGFA и VEGFC, за счёт ограничения количества свободных VEGFA и/или VEGFC и предотвращения их связывания с FLT4.

Модулирует сигнальнуе пути FLT1 и FLT4, образуя гетеродимеры с последними. Связывание VEGF с изоформой 1 VEGFR-2 приводит к активации нескольких сигнальных путей. Активация PLCG1 приводит к генерации таких вторичных посредников как диацилглицерина и 1,4,5-трифосфата и активации протеинкиназы C. Опосредует активацию сигнальных путей MAPK1/ERK2, MAPK3/ERK1 и the MAP-киназ, а также AKT1. Опосредует фосфорилирование регуляторной субъединицы фосфатидилинозитол-3-киназы PIK3R1. VEGFR-2 способен индуцировать NOS2 и NOS3, что приводит к синтезу окиси азота (NO) эндотелиальными клетками

Фофорилирует PLCG1, а также может фосфорилировать FYN, NCK1, NOS3, PIK3R1, PTK2/FAK1 и SRC[5][6].

Взаимодействия

VEGFR-2 взаимодействует с SHC2,[7] Аннексин A5[8] и SHC1.[9][10]

См. также

Литература

  • Holmes K., Roberts O.L., Thomas A.M., Cross M.J. Vascular endothelial growth factor receptor-2: structure, function, intracellular signalling and therapeutic inhibition (англ.) // Cellular Signalling[англ.] : journal. — 2007. — October (vol. 19, no. 10). — P. 2003—2012. — doi:10.1016/j.cellsig.2007.05.013. — PMID 17658244.
  • Petrova T.V., Makinen T., Alitalo K. Signaling via vascular endothelial growth factor receptors (англ.) // Experimental Cell Research[англ.] : journal. — 1999. — November (vol. 253, no. 1). — P. 117—130. — doi:10.1006/excr.1999.4707. — PMID 10579917.
  • Wang J., Fu X., Jiang C., Yu L., Wang M., Han W., Liu L., Wang J. Bone marrow mononuclear cell transplantation promotes therapeutic angiogenesis via upregulation of the VEGF-VEGFR2 signaling pathway in a rat model of vascular dementia (англ.) // Behavioural Brain Research[англ.] : journal. — 2014. — May (vol. 265). — P. 171—180. — doi:10.1016/j.bbr.2014.02.033. — PMID 24589546. — PMC 4000455.
  • Sato Y., Kanno S., Oda N., Abe M., Ito M., Shitara K., Shibuya M. Properties of two VEGF receptors, Flt-1 and KDR, in signal transduction (англ.) // Annals of the New York Academy of Sciences[англ.] : journal. — 2000. — May (vol. 902, no. 1). — P. 201—205. — doi:10.1111/j.1749-6632.2000.tb06314.x. — Bibcode: 2000NYASA.902..201S. — PMID 10865839.
  • Zachary I., Gliki G. Signaling transduction mechanisms mediating biological actions of the vascular endothelial growth factor family (англ.) // Cardiovascular Research[англ.] : journal. — 2001. — February (vol. 49, no. 3). — P. 568—581. — doi:10.1016/S0008-6363(00)00268-6. — PMID 11166270.
  • Vené R., Benelli R., Noonan D.M., Albini A. HIV-Tat dependent chemotaxis and invasion, key aspects of tat mediated pathogenesis (англ.) // Clinical & Experimental Metastasis : journal. — 2001. — Vol. 18, no. 7. — P. 533—538. — doi:10.1023/A:1011991906685. — PMID 11688957.
  • Lenton K. VEGFR-2 (KDR/Flk-1) (англ.) // Journal of Biological Regulators and Homeostatic Agents[нем.]. — 2003. — Vol. 16, no. 3. — P. 227—232. — PMID 12456025.
  • Matsumoto T., Mugishima H. Signal transduction via vascular endothelial growth factor (VEGF) receptors and their roles in atherogenesis (англ.) // Journal of Atherosclerosis and Thrombosis : journal. — 2006. — June (vol. 13, no. 3). — P. 130—135. — doi:10.5551/jat.13.130. — PMID 16835467.

Примечания

  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000128052 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000062960 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed:  (неопр.) Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Simons M., Gordon E., Claesson-Welsh L. Mechanisms and regulation of endothelial VEGF receptor signalling. (англ.) // Nat Rev Mol Cell Biol : journal. — 2016. — Vol. 17, no. 10. — P. 611—625. — doi:10.1038/nrm.2016.87. — PMID 27461391.
  6. Zafar M.I., Zheng J., Kong W., Ye X., Gou L., Regmi A et al. The role of vascular endothelial growth factor-B in metabolic homoeostasis: current evidence. (англ.) // Biosci Rep : journal. — 2017. — Vol. 37, no. 4. — doi:10.1042/BSR20171089. — PMID 28798193. — PMC 5577206.
  7. Warner A.J., Lopez-Dee J., Knight E.L., Feramisco J.R., Prigent S.A. The Shc-related adaptor protein, Sck, forms a complex with the vascular-endothelial-growth-factor receptor KDR in transfected cells (англ.) // The Biochemical Journal[англ.] : journal. — 2000. — April (vol. 347, no. Pt 2). — P. 501—509. — doi:10.1042/0264-6021:3470501. — PMID 10749680. — PMC 1220983.
  8. Wen Y., Edelman J.L., Kang T., Sachs G. Lipocortin V may function as a signaling protein for vascular endothelial growth factor receptor-2/Flk-1 (англ.) // Biochemical and Biophysical Research Communications[англ.] : journal. — 1999. — May (vol. 258, no. 3). — P. 713—721. — doi:10.1006/bbrc.1999.0678. — PMID 10329451.
  9. Zanetti A., Lampugnani M.G., Balconi G., Breviario F., Corada M., Lanfrancone L., Dejana E. Vascular endothelial growth factor induces SHC association with vascular endothelial cadherin: a potential feedback mechanism to control vascular endothelial growth factor receptor-2 signaling (англ.) // Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology[англ.] : journal. — 2002. — April (vol. 22, no. 4). — P. 617—622. — doi:10.1161/01.ATV.0000012268.84961.AD. — PMID 11950700.
  10. D'Angelo G., Martini J.F., Iiri T., Fantl W.J., Martial J., Weiner R.I. 16K human prolactin inhibits vascular endothelial growth factor-induced activation of Ras in capillary endothelial cells (англ.) // Molecular Endocrinology[англ.] : journal. — 1999. — May (vol. 13, no. 5). — P. 692—704. — doi:10.1210/mend.13.5.0280. — PMID 10319320.
Перейти к шаблону «Кластеры дифференцировки»
1-50
51-100
101-150
151-200
201-250
251-300
301-350
351-400