SIGLEC5

SIGLEC5
Доступные структуры PDB Поиск по базе UniProt: PDBe RCSB Список идентификаторов PDB 2ZG1, 2ZG2, 2ZG3
Идентификаторы
Псевдонимы	SIGLEC5, CD170, CD33L2, OB-BP2, OBBP2, SIGLEC-5, sialic acid binding Ig like lectin 5
Внешние ID	OMIM: 604200 HomoloGene: 55783 GeneCards: SIGLEC5
Расположение гена (человек) Хр. 19-я хромосома человека[1] Локус 19q13.41 Начало 51,610,960 bp[1] Конец 51,630,401 bp[1]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в upper lobe of left lung н/д Дополнительные справочные данные BioGPS Дополнительные справочные данные
Генная онтология Молекулярная функция связывание углеводов связывание с белками плазмы Компонент клетки часть мембраны мембрана клеточная мембрана secretory granule membrane tertiary granule membrane ficolin-1-rich granule membrane Биологический процесс агрегация клеток neutrophil degranulation Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 8778 н/д Ensembl ENSG00000268500 н/д UniProt O15389 н/д RefSeq (мРНК) NM_003830 NM_001384708 NM_001384709 н/д RefSeq (белок) NP_003821 н/д Локус (UCSC) Chr 19: 51.61 – 51.63 Mb н/д Поиск по PubMed Искать[2] н/д
Информация в Викиданных
Смотреть (человек)

SIGLEC5 (Sialic acid-binding Ig-like lectin 5; Ig-подобный лектин 5, связывающий сиаловую кислоту; CD170) — белок, молекула клеточной адгезии. Взаимодействует с сиаловыми кислотами. Продукт гена человека SIGLEC1^[3][4].

Локализация

Экспрессирован на моноцитах и нейтрофилах. Особенно высокая экспрессия обнаружена на клетках периферической крови, селезёнки и костного мозга, присутствует также на миелоидных клетках в лимфатических узлах, лёгких, аппендиксе, плаценте, поджелудочной железе и тимусе. SIGLEC1 отсутствует на лейкемических клетках, представляющих ранние этапы миеломоноцитической дифференцировки.

Литература

• Maruyama K., Sugano S. Oligo-capping: a simple method to replace the cap structure of eukaryotic mRNAs with oligoribonucleotides (англ.) // Gene^[англ.] : journal. — Elsevier, 1994. — Vol. 138, no. 1—2. — P. 171—174. — doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. — PMID 8125298.
• Suzuki Y., Yoshitomo-Nakagawa K., Maruyama K., etal. Construction and characterization of a full length-enriched and a 5'-end-enriched cDNA library (англ.) // Gene^[англ.] : journal. — Elsevier, 1997. — Vol. 200, no. 1—2. — P. 149—156. — doi:10.1016/S0378-1119(97)00411-3. — PMID 9373149.
• Cornish A. L., Freeman S., Forbes G., etal. Characterization of siglec-5, a novel glycoprotein expressed on myeloid cells related to CD33 (англ.) // Blood^[англ.] : journal. — American Society of Hematology^[англ.], 1998. — Vol. 92, no. 6. — P. 2123—2132. — PMID 9731071.
• Patel N., Brinkman-Van der Linden E. C., Altmann S. W., etal. OB-BP1/Siglec-6. A leptin- and sialic acid-binding protein of the immunoglobulin superfamily (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 1999. — Vol. 274, no. 32. — P. 22729—22738. — doi:10.1074/jbc.274.32.22729. — PMID 10428856.
• Yousef G. M., Ordon M. H., Foussias G., Diamandis E. P. Genomic organization of the siglec gene locus on chromosome 19q13.4 and cloning of two new siglec pseudogenes (англ.) // Gene^[англ.] : journal. — Elsevier, 2002. — Vol. 286, no. 2. — P. 259—270. — doi:10.1016/S0378-1119(02)00432-8. — PMID 11943481.
• Strausberg R. L., Feingold E. A., Grouse L. H., etal. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
• Erickson-Miller C. L., Freeman S. D., Hopson C. B., etal. Characterization of Siglec-5 (CD170) expression and functional activity of anti-Siglec-5 antibodies on human phagocytes (англ.) // Exp. Hematol.^[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 31, no. 5. — P. 382—388. — doi:10.1016/S0301-472X(03)00046-8. — PMID 12763136.
• Grimwood J., Gordon L. A., Olsen A., etal. The DNA sequence and biology of human chromosome 19 (англ.) // Nature : journal. — 2004. — Vol. 428, no. 6982. — P. 529—535. — doi:10.1038/nature02399. — PMID 15057824.
• Gerhard D. S., Wagner L., Feingold E. A., etal. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res.^[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.
• Avril T., Freeman S. D., Attrill H., etal. Siglec-5 (CD170) can mediate inhibitory signaling in the absence of immunoreceptor tyrosine-based inhibitory motif phosphorylation (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — 2005. — Vol. 280, no. 20. — P. 19843—19851. — doi:10.1074/jbc.M502041200. — PMID 15769739.
• Rual J. F., Venkatesan K., Hao T., etal. Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network (англ.) // Nature : journal. — 2005. — Vol. 437, no. 7062. — P. 1173—1178. — doi:10.1038/nature04209. — PMID 16189514.
• Rapoport E. M., Pazynina G. V., Sablina M. A., etal. Probing sialic acid binding Ig-like lectins (siglecs) with sulfated oligosaccharides (англ.) // Biochemistry Mosc.^[англ.] : journal. — 2006. — Vol. 71, no. 5. — P. 496—504. — doi:10.1134/S0006297906050051. — PMID 16732727.
• Biedermann B., Gil D., Bowen D. T., Crocker P. R. Analysis of the CD33-related siglec family reveals that Siglec-9 is an endocytic receptor expressed on subsets of acute myeloid leukemia cells and absent from normal hematopoietic progenitors (англ.) // Leuk. Res.^[англ.] : journal. — 2007. — Vol. 31, no. 2. — P. 211—220. — doi:10.1016/j.leukres.2006.05.026. — PMID 16828866.
• Angata T., Hayakawa T., Yamanaka M., etal. Discovery of Siglec-14, a novel sialic acid receptor undergoing concerted evolution with Siglec-5 in primates (англ.) // The FASEB Journal^[англ.] : journal. — Federation of American Societies for Experimental Biology^[англ.], 2006. — Vol. 20, no. 12. — P. 1964—1973. — doi:10.1096/fj.06-5800com. — PMID 17012248.
• Zhuravleva M. A., Trandem K., Sun P. D. STRUCTURAL IMPLICATIONS OF SIGLEC-5 MEDIATED SIALO-GLYCAN RECOGNITION (нем.) // J. Mol. Biol.^[англ.] : magazin. — 2007. — Bd. 375, Nr. 2. — S. 437—447. — doi:10.1016/j.jmb.2007.10.009. — PMID 18022638. — PMC 2245879.

Примечания