CLEC10A

CLEC10A
Идентификаторы
Псевдонимы	CLEC10A, CD301, CLECSF13, CLECSF14, HML, HML2, MGL, C-type lectin domain family 10 member A, C-type lectin domain containing 10A
Внешние ID	OMIM: 605999 MGI: 96975 HomoloGene: 7836 GeneCards: CLEC10A
Расположение гена (человек) Хр. 17-я хромосома человека[1] Локус 17p13.1 Начало 7,074,537 bp[1] Конец 7,080,307 bp[1]
Расположение гена (Мышь) Хр. 11-я хромосома мыши[2] Локус 11 B3|11 42.99 cM Начало 70,047,023 bp[2] Конец 70,061,660 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК Bgee Человек Мышь (ортолог) Наибольшая экспрессия в secondary oocyte Наибольшая экспрессия в subcutaneous adipose tissue skin of back secondary oocyte Дополнительные справочные данные BioGPS н/д
Генная онтология Молекулярная функция связывание углеводов Компонент клетки часть мембраны клеточная мембрана мембрана Биологический процесс врождённый иммунитет эндоцитоз adaptive immune response immune system process stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи Вид Человек Мышь Entrez 10462 17312 Ensembl ENSG00000132514 ENSMUSG00000000318 UniProt Q8IUN9 P49300 RefSeq (мРНК) NM_006344 NM_182906 NM_001330070 NM_001204252 NM_010796 RefSeq (белок) NP_001316999 NP_006335 NP_878910 NP_001191181 NP_034926 Локус (UCSC) Chr 17: 7.07 – 7.08 Mb Chr 11: 70.05 – 70.06 Mb Поиск по PubMed Искать[3] Искать[4]
Информация в Викиданных
Смотреть (человек) Смотреть (мышь)

CLEC10A (англ. C-type lectin domain family 10 member A, лектин С-типа домен семейство 10 член A) — мембранный белок, лектин типа С. Продукт гена человека CLEC10A^[5].

Функции

Белок относится к суперсемейству белков CTL/CTLD (лектин типа С/лектин типа С-подобный домен). Члены этого семейства имеют сходную белковую структуру и обладают разнообразными функциями, такими как адгезия клеток, межклеточная передача сигнала, метаболизм гликопротеинов, роль в воспалении и иммунном ответе. CLEC10A является трансмембранным белком 2-го типа и может функционировать как клеточный поверхностный антиген. Существует две изоформы белка^[6].

Участвует в регуляции врождённого и приобретённого иммунитета. Связывает концевые галактозу и N-ацетилгалактозамин, связанные с серином или треонином. Подобные углеводные соединения известны как Tn-Ag и экспрессированы на клетках различных карцином.

Структура

Белок состоит из 316 аминокислот, содержит один трансмембранный домен. Внеклеточный домен содержит два участка N-гликозилирования аспарагиновых остатков и 3 дисульфидные связи.

Примечания

Литература

• Bonaldo M.F., Lennon G., Soares M.B. Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery. (англ.) // Genome Res.^[англ.] : journal. — 1996. — Vol. 6, no. 9. — P. 791—806. — doi:10.1101/gr.6.9.791. — PMID 8889548.
• Strausberg R.L., Feingold E.A., Grouse L.H. et al. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2002. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932. — PMC 139241.
• van Vliet S.J., Steeghs L., Bruijns S.C. et al. Variation of Neisseria gonorrhoeae Lipooligosaccharide Directs Dendritic Cell–Induced T Helper Responses (англ.) // PLoS Pathog. : journal / Seifert, H. Steven. — 2009. — Vol. 5, no. 10. — P. e1000625. — doi:10.1371/journal.ppat.1000625. — PMID 19834553. — PMC 2757725.
• Iijima M., Tomita M., Morozumi S. et al. Single nucleotide polymorphism of TAG-1 influences IVIg responsiveness of Japanese patients with CIDP (англ.) // Neurology^[англ.] : journal. — Wolters Kluwer^[англ.], 2009. — Vol. 73, no. 17. — P. 1348—1352. — doi:10.1212/WNL.0b013e3181bd1139. — PMID 19776380.
• Gerhard D.S., Wagner L., Feingold E.A. et al. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Res.^[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334. — PMC 528928.