OPN3

OPN3
Ідентифікатори
Символи OPN3, ECPN, PPP1R116, opsin 3
Зовнішні ІД OMIM: 606695 MGI: 1338022 HomoloGene: 40707 GeneCards: OPN3
Онтологія гена
Молекулярна функція

G protein-coupled receptor activity
photoreceptor activity
signal transducer activity
G protein-coupled photoreceptor activity

Клітинна компонента

integral component of membrane
integral component of plasma membrane
мембрана
photoreceptor outer segment

Біологічний процес

G protein-coupled receptor signaling pathway
regulation of circadian rhythm
GO:0072468 сигнальна трансдукція
відповідь на стимул
detection of light stimulus
detection of visible light
phototransduction
cellular response to light stimulus

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
23596
13603
Ensembl
н/д
ENSMUSG00000026525
UniProt
Q9H1Y3
Q9WUK7
RefSeq (мРНК)
NM_014322
NM_001030011
NM_001030012
NM_001381855
NM_001381856
NM_010098
RefSeq (білок)
NP_055137
NP_001368784
NP_001368785
NP_034228
Локус (UCSC) н/д Хр. 1: 175.49 – 175.52 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

OPN3 (англ. Opsin 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 402 амінокислот, а молекулярна маса — 44 873[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MYSGNRSGGHGYWDGGGAAGAEGPAPAGTLSPAPLFSPGTYERLALLLGS
IGLLGVGNNLLVLVLYYKFQRLRTPTHLLLVNISLSDLLVSLFGVTFTFV
SCLRNGWVWDTVGCVWDGFSGSLFGIVSIATLTVLAYERYIRVVHARVIN
FSWAWRAITYIWLYSLAWAGAPLLGWNRYILDVHGLGCTVDWKSKDANDS
SFVLFLFLGCLVVPLGVIAHCYGHILYSIRMLRCVEDLQTIQVIKILKYE
KKLAKMCFLMIFTFLVCWMPYIVICFLVVNGHGHLVTPTISIVSYLFAKS
NTVYNPVIYVFMIRKFRRSLLQLLCLRLLRCQRPAKDLPAAGSEMQIRPI
VMSQKDGDRPKKKVTFNSSSIIFIITSDESLSVDDSDKTNGSKVDVIQVR
PL

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу. Задіяний у таких біологічних процесах як поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з хромофором. Локалізований у мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Blackshaw S., Snyder S.H. (1999). Encephalopsin: a novel mammalian extraretinal opsin discretely localized in the brain. J. Neurosci. 19: 3681—3690. PMID 10234000

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14007 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.
  4. UniProt, Q9H1Y3 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

  • Хромосома 1
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
 
Клас A: Родопсин-подібні
Рецептори нейромедіаторів
Адренорецептори
Пуринові рецептори
Серотонінові рецептори
Інші
Метаболіти та
сигнальні молекули
Ейкозаноїдні рецептори
Інші
Пептиди
Рецептори нейропептидів
  • B/W
  • FF
  • S
  • Y
  • Нейромедин
  • Нейротенсин
Інші
Різні
Смак, гірке
Орфанні
Інші
 
Клас B: Секретин-подібні
Адгезивні
Орфанні
Інші
 
Смак, солодке
  • TAS1R
  • VN2R
Other
 
Клас F: FZD & SMO
FZD
SMO
  • SMO