OPN1LW

OPN1LW
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

1KPX

Ідентифікатори
Символи OPN1LW, CBBM, CBP, COD5, RCP, ROP, opsin 1 (cone pigments), long-wave-sensitive, opsin 1, long wave sensitive
Зовнішні ІД OMIM: 300822 MGI: 1097692 HomoloGene: 68064 GeneCards: OPN1LW
Пов'язані генетичні захворювання
blue cone monochromacy[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

G protein-coupled receptor activity
photoreceptor activity
signal transducer activity
G protein-coupled photoreceptor activity

Клітинна компонента

integral component of membrane
integral component of plasma membrane
мембрана
photoreceptor outer segment
photoreceptor disc membrane

Біологічний процес

positive regulation of cytokinesis
GO:0072468 сигнальна трансдукція
зір
retinoid metabolic process
відповідь на стимул
phototransduction
detection of visible light
G protein-coupled receptor signaling pathway
cellular response to light stimulus

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
5956
14539
Ensembl
ENSG00000102076
ENSMUSG00000031394
UniProt
P04000
O35599
RefSeq (мРНК)
NM_020061
NM_008106
RefSeq (білок)
NP_064445
NP_032132
Локус (UCSC) Хр. X: 154.14 – 154.16 Mb Хр. X: 73.17 – 73.19 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

OPN1LW (англ. Opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive (color blindness, deutan)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359 амінокислот, а молекулярна маса — 40 218[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAQRLTGEQTLDHYEDSTHASIFTYTNSNSTKGPFEGPNYHIAPRWVYHL
TSTWMILVVVASVFTNGLVLAATMRFKKLRHPLNWILVNLAVADLAETII
ASTISVVNQIYGYFVLGHPLCVIEGYIVSLCGITGLWSLAIISWERWLVV
CKPFGNVRFDAKLATVGIVFSWVWAAIWTAPPIFGWSRYWPYGLKTSCGP
DVFSGTSYPGVQSYMMVLMVTCCIFPLSIIVLCYLQVWLAIRAVAKQQKE
SESTQKAEKEVTRMVVVMVFAYCLCWGPYTFFACFATAHPGYAFHPLVAS
LPSYFAKSATIYNPIIYVFMNRQFRNCILHLFGKKVDDSSELSSTSKTEV
SSVSSVSPA

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з хромофором. Локалізований у мембрані.

Література

  • Sun H., Macke J.P., Nathans J. (1997). Mechanisms of spectral tuning in the mouse green cone pigment. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 8860—8865. PMID 9238068 DOI:10.1073/pnas.94.16.8860
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з OPN1LW переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2015. Процитовано 13 лютого 2018.
  5. UniProt, O35599 (англ.) . Архів оригіналу за 14 лютого 2018. Процитовано 13 лютого 2018.

Див. також

Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
 
Клас A: Родопсин-подібні
Рецептори нейромедіаторів
Адренорецептори
Пуринові рецептори
Серотонінові рецептори
Інші
Метаболіти та
сигнальні молекули
Ейкозаноїдні рецептори
Інші
Пептиди
Рецептори нейропептидів
  • B/W
  • FF
  • S
  • Y
  • Нейромедин
  • Нейротенсин
Інші
Різні
Смак, гірке
Орфанні
Інші
 
Клас B: Секретин-подібні
Адгезивні
Орфанні
Інші
 
Смак, солодке
  • TAS1R
  • VN2R
Other
 
Клас F: FZD & SMO
FZD
SMO
  • SMO