OPN1SW

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1KPN

Ідентифікатори

Символи

OPN1SW, BCP, BOP, CBT, opsin 1 (cone pigments), short-wave-sensitive, opsin 1, short wave sensitive

Зовнішні ІД

OMIM: 613522 MGI: 99438 HomoloGene: 1291 GeneCards: OPN1SW

Пов'язані генетичні захворювання

тританопія^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• G protein-coupled receptor activity • photoreceptor activity • signal transducer activity • G protein-coupled photoreceptor activity • signaling receptor activity
Клітинна компонента	• integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • photoreceptor outer segment • photoreceptor disc membrane
Біологічний процес	• відповідь на стимул • GO:0072468 сигнальна трансдукція • зір • retinoid metabolic process • phototransduction • detection of visible light • G protein-coupled receptor signaling pathway • cellular response to light stimulus
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


611


12057

Ensembl


ENSG00000128617


ENSMUSG00000058831

UniProt


P03999


P51491

RefSeq (мРНК)


NM_001708 NM_001385125


NM_007538

RefSeq (білок)


NP_001699


NP_031564

Локус (UCSC)

Хр. 7: 128.77 – 128.78 Mb

Хр. 6: 29.38 – 29.39 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

OPN1SW (англ. Opsin 1, short wave sensitive) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 348 амінокислот, а молекулярна маса — 39 135^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRKMSEEEFY	LFKNISSVGP	WDGPQYHIAP	VWAFYLQAAF	MGTVFLIGFP
LNAMVLVATL	RYKKLRQPLN	YILVNVSFGG	FLLCIFSVFP	VFVASCNGYF
VFGRHVCALE	GFLGTVAGLV	TGWSLAFLAF	ERYIVICKPF	GNFRFSSKHA
LTVVLATWTI	GIGVSIPPFF	GWSRFIPEGL	QCSCGPDWYT	VGTKYRSESY
TWFLFIFCFI	VPLSLICFSY	TQLLRALKAV	AAQQQESATT	QKAEREVSRM
VVVMVGSFCV	CYVPYAAFAM	YMVNNRNHGL	DLRLVTIPSF	FSKSACIYNP
IIYCFMNKQF	QACIMKMVCG	KAMTDESDTC	SSQKTEVSTV	SSTQVGPN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з хромофором. Локалізований у мембрані.

Література

Nathans J., Thomas D., Hogness D.S. (1986). Molecular genetics of human color vision: the genes encoding blue, green, and red pigments. Science. 232: 193—202. PMID 2937147 DOI:10.1126/science.2937147
Shimmin L.C., Mai P., Li W.H. (1997). Sequences and evolution of human and squirrel monkey blue opsin genes. J. Mol. Evol. 44: 378—382. PMID 9089077 DOI:10.1007/PL00006157
Sarkar G., Sommer S.S. (1989). Access to a messenger RNA sequence or its protein product is not limited by tissue or species specificity. Science. 244: 331—334. PMID 2565599 DOI:10.1126/science.2565599
Applebury M.L., Hargrave P.A. (1986). Molecular biology of the visual pigments. Vision Res. 26: 1881—1895. PMID 3303660 DOI:10.1016/0042-6989(86)90115-X
Weitz C.J., Went L.N., Nathans J. (1992). Human tritanopia associated with a third amino acid substitution in the blue-sensitive visual pigment. Am. J. Hum. Genet. 51: 444—446. PMID 1386496

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з OPN1SW переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1012 (англ.) . Архів оригіналу за 1 квітня 2016. Процитовано 7 вересня 2017.
↑ UniProt, P03999 (англ.) . Архів оригіналу за 7 травня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

Трансмембранні рецептори: G-білокспряжені рецептори

Клас A: Родопсин-подібні

Рецептори нейромедіаторів

Адренорецептори	α1 A B D α2 A B C β1 β2 β3

Пуринові рецептори	Аденозинові рецептори A1 A2A A2B A3 P2Y 1 2 4 5 6 8 9 10 11 12 13 14

Серотонінові рецептори	(крім 5-HT3) 5-HT1 A B D E F) 5-HT2 A B C 5-HT 4 5A 6 7)

Інші	Мускариновий ацетилхоліновий рецептор M1 M2 M3 M4 M5 Дофамінові рецептори D1 D2 D3 D4 D5 GHB-рецептор Гістамінові рецептори H1 H2 H3 H4 Мелатонінові рецептори 1A 1B 1C TAAR 1 2 5 6 8 9

Метаболіти та
сигнальні молекули

Ейкозаноїдні рецептори	CysLT 1 2 LTB4 1 2 FPR2 OXER1 Простагландинові рецептори DP 1 2 EP 1 2 3 4) FP PTGIR TBXA2R

Інші	Жовчні кислоти Канабіноїдні рецептори CB1 CB2 GPR 18 55 119 EBI2 Естроген Рецептори вільних жирних кислот 1 2 3 4 HCAR 1 2 3 LPAR 1 2 3 4 5 6 S1PR 1 2 3 4 5 OXGR1 PTAFR SUCNR1

Пептиди

Рецептори нейропептидів	B/W 1 2 FF 1 2 S Y 1 2 4 5 Нейромедин B U 1 2 Нейротенсин 1 2

Інші	Анафілатоксин C3a C5a 1 2 Ангіатонзин 1 2 Апелін Бомбезин BRS3 GRPR NMBR Брадикинін B1 B2 Хемокиновий рецептор Холецистокинін A B Ендотилін A B FPR 1 2 3 FSHR Галанін 1 2 3 GNRHR 1 2 GHSR KISS1R LHCGR MAS 1 1L D E F G X1 X2 X3 X4 Меланокортин 1 2 3 4 5 MCHR 1 2 MLNR Опіати Δ Κ Μ OPRL1 OGFR Орексин 1 2 Окситоцин Прокінетецин 1 2 PRLHR Релаксин 1 2 3 4 Рецептори соматостатинів 1 2 3 4 5 Тахінін 1 2 3 Рецептор тиреотропного гормону TRHR UTS2R Рецептори вазопресину 1A 1B 2

Різні

Смак, гірке	TAS2R 1 3 4 5 7 8 9 10 13 14 16 19 20 30 31 38 39 40 41 42 43 45 46 50 60 VN1R 1 2 3 4 5

Орфанні	GPR (1 3 4 6 12 15 17 18 19 20 21 22 23 25 26 27 31 32 33 34 35 37 39 42 44 45 50 52 55 61 62 63 65 68 75 77 78 81 82 83 84 85 87 88 92 101 103 109A 109B 119 120 132 135 137B 139 141 142 146 148 149 150 151 152 153 160 161 162 171 173 174 176 177 182 183)

Інші	GPR182 Запах Опсин 3 4 5 1LW 1MW 1SW RGR RRH F2R 1 2 3 4 SREB 1 2 3

Клас B: Секретин-подібні

Адгезивні	ADGRG 1 2 3 4 5 6 7

Орфанні	GPR (56 64 97 98 110 111 112 113 114 115 116 123 124 125 126 128 133 143 144 155 157)

Інші	ADGRB 1 2 3 CELSR 1 2 3 Кальцитонін CALCRL ADGRE5 CRHR 1 2 EMR 1 2 3 Глюкагон GR GIPR GLP1R GLP2R GHRHR PACAPR1 Латрофілін 1 2 3 4 PTH 1 2 SCTR VIPR 1 2

Клас C: Метаботропні глутаматні рецептори / феромони

Смак, солодке	TAS1R 1 2 3 VN2R

Other	CASR ГАМК-рецептори 1 2 Глутаматні рецептори Метаботропні глутаматні 1 2 3 4 5 6 7 8 GPRC6A GPR 156 158 179 RAIG 1 2 3 4