CELSR1

CELSR1
Ідентифікатори
Символи CELSR1, CDHF9, FMI2, HFMI2, ME2, ADGRC1, cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1, LMPHM9
Зовнішні ІД OMIM: 604523 MGI: 1100883 HomoloGene: 7665 GeneCards: CELSR1
Онтологія гена
Молекулярна функція

calcium ion binding
G protein-coupled receptor activity
protein dimerization activity
signal transducer activity
transmembrane signaling receptor activity

Клітинна компонента

integral component of membrane
мембрана
клітинна мембрана
integral component of plasma membrane
нуклеоплазма

Біологічний процес

hair follicle development
planar dichotomous subdivision of terminal units involved in lung branching morphogenesis
G protein-coupled receptor signaling pathway
lateral sprouting involved in lung morphogenesis
regulation of actin cytoskeleton organization
locomotory behavior
orthogonal dichotomous subdivision of terminal units involved in lung branching morphogenesis
establishment of planar polarity of embryonic epithelium
establishment of planar polarity
Загоєння ран
neuron migration
establishment of body hair planar orientation
planar cell polarity pathway involved in neural tube closure
multicellular organism development
Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway
central nervous system development
cell surface receptor signaling pathway
neural tube closure
адгезія клітин
inner ear morphogenesis
apical protein localization
Rho protein signal transduction
anterior/posterior pattern specification
GO:0072468 сигнальна трансдукція
homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules
protein localization involved in establishment of planar polarity
cell-cell adhesion

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
9620
12614
Ensembl
ENSG00000075275
ENSMUSG00000016028
UniProt
Q9NYQ6
O35161
RefSeq (мРНК)
NM_014246
NM_001378328
NM_009886
RefSeq (білок)
NP_055061
NP_001365257
NP_034016
Локус (UCSC) Хр. 22: 46.36 – 46.54 Mb Хр. 15: 85.78 – 85.92 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CELSR1 (англ. Cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 014 амінокислот, а молекулярна маса — 329 486[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MAPPPPPVLPVLLLLAAAAALPAMGLRAAAWEPRVPGGTRAFALRPGCTY
AVGAACTPRAPRELLDVGRDGRLAGRRRVSGAGRPLPLQVRLVARSAPTA
LSRRLRARTHLPGCGARARLCGTGARLCGALCFPVPGGCAAAQHSALAAP
TTLPACRCPPRPRPRCPGRPICLPPGGSVRLRLLCALRRAAGAVRVGLAL
EAATAGTPSASPSPSPPLPPNLPEARAGPARRARRGTSGRGSLKFPMPNY
QVALFENEPAGTLILQLHAHYTIEGEEERVSYYMEGLFDERSRGYFRIDS
ATGAVSTDSVLDRETKETHVLRVKAVDYSTPPRSATTYITVLVKDTNDHS
PVFEQSEYRERVRENLEVGYEVLTIRASDRDSPINANLRYRVLGGAWDVF
QLNESSGVVSTRAVLDREEAAEYQLLVEANDQGRNPGPLSATATVYIEVE
DENDNYPQFSEQNYVVQVPEDVGLNTAVLRVQATDRDQGQNAAIHYSILS
GNVAGQFYLHSLSGILDVINPLDFEDVQKYSLSIKAQDGGRPPLINSSGV
VSVQVLDVNDNEPIFVSSPFQATVLENVPLGYPVVHIQAVDADSGENARL
HYRLVDTASTFLGGGSAGPKNPAPTPDFPFQIHNSSGWITVCAELDREEV
EHYSFGVEAVDHGSPPMSSSTSVSITVLDVNDNDPVFTQPTYELRLNEDA
AVGSSVLTLQARDRDANSVITYQLTGGNTRNRFALSSQRGGGLITLALPL
DYKQEQQYVLAVTASDGTRSHTAHVLINVTDANTHRPVFQSSHYTVSVSE
DRPVGTSIATLSANDEDTGENARITYVIQDPVPQFRIDPDSGTMYTMMEL
DYENQVAYTLTIMAQDNGIPQKSDTTTLEILILDANDNAPQFLWDFYQGS
IFEDAPPSTSILQVSATDRDSGPNGRLLYTFQGGDDGDGDFYIEPTSGVI
RTQRRLDRENVAVYNLWALAVDRGSPTPLSASVEIQVTILDINDNAPMFE
KDELELFVEENNPVGSVVAKIRANDPDEGPNAQIMYQIVEGDMRHFFQLD
LLNGDLRAMVELDFEVRREYVLVVQATSAPLVSRATVHILLVDQNDNPPV
LPDFQILFNNYVTNKSNSFPTGVIGCIPAHDPDVSDSLNYTFVQGNELRL
LLLDPATGELQLSRDLDNNRPLEALMEVSVSDGIHSVTAFCTLRVTIITD
DMLTNSITVRLENMSQEKFLSPLLALFVEGVAAVLSTTKDDVFVFNVQND
TDVSSNILNVTFSALLPGGVRGQFFPSEDLQEQIYLNRTLLTTISTQRVL
PFDDNICLREPCENYMKCVSVLRFDSSAPFLSSTTVLFRPIHPINGLRCR
CPPGFTGDYCETEIDLCYSDPCGANGRCRSREGGYTCECFEDFTGEHCEV
DARSGRCANGVCKNGGTCVNLLIGGFHCVCPPGEYERPYCEVTTRSFPPQ
SFVTFRGLRQRFHFTISLTFATQERNGLLLYNGRFNEKHDFIALEIVDEQ
VQLTFSAGETTTTVAPKVPSGVSDGRWHSVQVQYYNKPNIGHLGLPHGPS
GEKMAVVTVDDCDTTMAVRFGKDIGNYSCAAQGTQTGSKKSLDLTGPLLL
GGVPNLPEDFPVHNRQFVGCMRNLSVDGKNVDMAGFIANNGTREGCAARR
NFCDGRRCQNGGTCVNRWNMYLCECPLRFGGKNCEQAMPHPQLFSGESVV
SWSDLNIIISVPWYLGLMFRTRKEDSVLMEATSGGPTSFRLQILNNYLQF
EVSHGPSDVESVMLSGLRVTDGEWHHLLIELKNVKEDSEMKHLVTMTLDY
GMDQNKADIGGMLPGLTVRSVVVGGASEDKVSVRRGFRGCMQGVRMGGTP
TNVATLNMNNALKVRVKDGCDVDDPCTSSPCPPNSRCHDAWEDYSCVCDK
GYLGINCVDACHLNPCENMGACVRSPGSPQGYVCECGPSHYGPYCENKLD
LPCPRGWWGNPVCGPCHCAVSKGFDPDCNKTNGQCQCKENYYKLLAQDTC
LPCDCFPHGSHSRTCDMATGQCACKPGVIGRQCNRCDNPFAEVTTLGCEV
IYNGCPKAFEAGIWWPQTKFGQPAAVPCPKGSVGNAVRHCSGEKGWLPPE
LFNCTTISFVDLRAMNEKLSRNETQVDGARALQLVRALRSATQHTGTLFG
NDVRTAYQLLGHVLQHESWQQGFDLAATQDADFHEDVIHSGSALLAPATR
AAWEQIQRSEGGTAQLLRRLEGYFSNVARNVRRTYLRPFVIVTANMILAV
DIFDKFNFTGARVPRFDTIHEEFPRELESSVSFPADFFRPPEEKEGPLLR
PAGRRTTPQTTRPGPGTEREAPISRRRRHPDDAGQFAVALVIIYRTLGQL
LPERYDPDRRSLRLPHRPIINTPMVSTLVYSEGAPLPRPLERPVLVEFAL
LEVEERTKPVCVFWNHSLAVGGTGGWSARGCELLSRNRTHVACQCSHTAS
FAVLMDISRRENGEVLPLKIVTYAAVSLSLAALLVAFVLLSLVRMLRSNL
HSIHKHLAVALFLSQLVFVIGINQTENPFLCTVVAILLHYIYMSTFAWTL
VESLHVYRMLTEVRNIDTGPMRFYYVVGWGIPAIVTGLAVGLDPQGYGNP
DFCWLSLQDTLIWSFAGPIGAVIIINTVTSVLSAKVSCQRKHHYYGKKGI
VSLLRTAFLLLLLISATWLLGLLAVNRDALSFHYLFAIFSGLQGPFVLLF
HCVLNQEVRKHLKGVLGGRKLHLEDSATTRATLLTRSLNCNTTFGDGPDM
LRTDLGESTASLDSIVRDEGIQKLGVSSGLVRGSHGEPDASLMPRSCKDP
PGHDSDSDSELSLDEQSSSYASSHSSDSEDDGVGAEEKWDPARGAVHSTP
KGDAVANHVPAGWPDQSLAESDSEDPSGKPRLKVETKVSVELHREEQGSH
RGEYPPDQESGGAARLASSQPPEQRKGILKNKVTYPPPLTLTEQTLKGRL
REKLADCEQSPTSSRTSSLGSGGPDCAITVKSPGREPGRDHLNGVAMNVR
TGSAQADGSDSEKP

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

  • Wu Q., Maniatis T. (2000). Large exons encoding multiple ectodomains are a characteristic feature of protocadherin genes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 3124—3129. PMID 10716726 DOI:10.1073/pnas.97.7.3124
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1850 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 12 вересня 2017.
  4. UniProt, Q9NYQ6 (англ.) . Архів оригіналу за 12 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

  • Хромосома 22
Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

  • п
  • о
  • р
 
Клас A: Родопсин-подібні
Рецептори нейромедіаторів
Адренорецептори
Пуринові рецептори
Серотонінові рецептори
Інші
Метаболіти та
сигнальні молекули
Ейкозаноїдні рецептори
Інші
Пептиди
Рецептори нейропептидів
  • B/W
  • FF
  • S
  • Y
  • Нейромедин
  • Нейротенсин
Інші
Різні
Смак, гірке
Орфанні
Інші
 
Клас B: Секретин-подібні
Адгезивні
Орфанні
Інші
 
Смак, солодке
  • TAS1R
  • VN2R
Other
 
Клас F: FZD & SMO
FZD
SMO
  • SMO