TYMS

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1YPV, 1JU6, 2RDA, 3EF9, 3ED7, 1HW3, 3EHI, 3GH0, 4JEF, 4O1X, 1HZW, 3EAW, 3OB7, 3EBU, 4KPW, 3EGY, 3EJL, 3N5G, 3N5E, 1HVY, 4GD7, 4G2O, 4H1I, 2ONB, 3H9K, 4GYH, 3HB8, 1I00, 3GG5, 4FGT, 2RD8, 3EDW, 4G6W, 1HW4, 3GH2, 4E28, 1JUJ, 4O1U, 4UP1, 5HS3,%%s1HW3, 1YPV, 4GD7, 2ONB

Ідентифікатори

Символи

TYMS, HST422, TMS, TS, thymidylate synthetase

Зовнішні ІД

OMIM: 188350 MGI: 98878 HomoloGene: 834 GeneCards: TYMS

Реагує на сполуку

Капецитабін, pemetrexed, raltitrexed^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0102674, GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • nucleotide binding • protein homodimerization activity • folic acid binding • thymidylate synthase activity • mRNA binding • translation repressor activity, mRNA regulatory element binding • sequence-specific mRNA binding
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • мітохондріальний матрикс • ядерце • мітохондрія • мітохондріальна внутрішня мембрана • клітинне ядро
Біологічний процес	• response to cytokine • nucleotide biosynthetic process • DNA biosynthetic process • GO:1904578 response to organic cyclic compound • response to progesterone • tetrahydrofolate interconversion • GO:0010260 старіння людини • response to glucocorticoid • regulation of transcription involved in G1/S transition of mitotic cell cycle • dTTP biosynthetic process • tetrahydrofolate metabolic process • response to vitamin A • cartilage development • Метилювання • developmental growth • response to organophosphorus • циркадний ритм • uracil metabolic process • dTMP biosynthetic process • intestinal epithelial cell maturation • dUMP metabolic process • response to folic acid • response to ethanol • response to toxic substance • pyrimidine nucleobase metabolic process • regulation of translation • liver regeneration • nucleobase-containing small molecule interconversion • negative regulation of translation
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


7298


22171

Ensembl


ENSG00000176890


ENSMUSG00000025747

UniProt


P04818 Q53Y97


P07607

RefSeq (мРНК)


NM_001071 NM_001354867 NM_001354868


NM_021288

RefSeq (білок)


NP_001062 NP_001341796 NP_001341797 NP_001062.1


NP_067263

Локус (UCSC)

Хр. 18: 0.66 – 0.67 Mb

Хр. 5: 30.26 – 30.28 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TYMS (англ. Thymidylate synthetase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 313 амінокислот, а молекулярна маса — 35 716^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPVAGSELPR	RPLPPAAQER	DAEPRPPHGE	LQYLGQIQHI	LRCGVRKDDR
TGTGTLSVFG	MQARYSLRDE	FPLLTTKRVF	WKGVLEELLW	FIKGSTNAKE
LSSKGVKIWD	ANGSRDFLDS	LGFSTREEGD	LGPVYGFQWR	HFGAEYRDME
SDYSGQGVDQ	LQRVIDTIKT	NPDDRRIIMC	AWNPRDLPLM	ALPPCHALCQ
FYVVNSELSC	QLYQRSGDMG	LGVPFNIASY	ALLTYMIAHI	TGLKPGDFIH
TLGDAHIYLN	HIEPLKIQLQ	REPRPFPKLR	ILRKVEKIDD	FKAEDFQIEG
YNPHPTIKME	MAV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, мітохондрії, внутрішній мембрані мітохондрії.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Anderson D.D., Quintero C.M., Stover P.J. (2011). Identification of a de novo thymidylate biosynthesis pathway in mammalian mitochondria. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 108: 15163—15168. PMID 21876188 DOI:10.1073/pnas.1103623108
Schiffer C.A., Clifton I.J., Davisson V.J., Santi D.V., Stroud R.M. (1995). Crystal structure of human thymidylate synthase: a structural mechanism for guiding substrates into the active site. Biochemistry. 34: 16279—16287. PMID 8845352 DOI:10.1021/bi00050a007
Shimizu K., Ayusawa D., Takeishi K., Seno T. (1985). Purification and NH2-terminal amino acid sequence of human thymidylate synthase in an overproducing transformant of mouse FM3A cells. J. Biochem. 97: 845—850. PMID 3839505
Davisson V.J., Sirawaraporn W., Santi D.V. (1989). Expression of human thymidylate synthase in Escherichia coli. J. Biol. Chem. 264: 9145—9148. PMID 2656695

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з TYMS переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12441 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, P04818 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.