TRIM23

Ідентифікатори

Символи

TRIM23, ARD1, ARFD1, RNF46, tripartite motif containing 23

Зовнішні ІД

OMIM: 601747 MGI: 1933161 HomoloGene: 1251 GeneCards: TRIM23

Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0010577 enzyme activator activity • identical protein binding • GO:0006184 GTPase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GDP binding • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • nucleotide binding • GTP binding • transferase activity • nucleic acid binding
Клітинна компонента	• система ендомембран • Golgi membrane • клітинне ядро • lysosomal membrane • внутрішньоклітинний • мембрана • лізосома • цитоплазма • комплекс Ґольджі • клітинна мембрана
Біологічний процес	• Убіквітин-залежний протеоліз • GO:0022415 viral process • GO:0048554 positive regulation of catalytic activity • процес імунної системи • вроджений імунітет • intracellular protein transport • Golgi to plasma membrane transport • vesicle-mediated transport
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


373


81003

Ensembl


ENSG00000113595


ENSMUSG00000021712

UniProt


P36406


Q8BGX0

RefSeq (мРНК)


NM_001656 NM_033227 NM_033228


NM_030731 NM_001361538 NM_001361539

RefSeq (білок)


NP_001647 NP_150230 NP_150231


NP_001348467 NP_001348468

Локус (UCSC)

Хр. 5: 65.59 – 65.63 Mb

Хр. 13: 104.32 – 104.34 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

TRIM23 (англ. Tripartite motif containing 23) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 574 амінокислот, а молекулярна маса — 64 067^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATLVVNKLG	AGVDSGRQGS	RGTAVVKVLE	CGVCEDVFSL	QGDKVPRLLL
CGHTVCHDCL	TRLPLHGRAI	RCPFDRQVTD	LGDSGVWGLK	KNFALLELLE
RLQNGPIGQY	GAAEESIGIS	GESIIRCDED	EAHLASVYCT	VCATHLCSEC
SQVTHSTKTL	AKHRRVPLAD	KPHEKTMCSQ	HQVHAIEFVC	LEEGCQTSPL
MCCVCKEYGK	HQGHKHSVLE	PEANQIRASI	LDMAHCIRTF	TEEISDYSRK
LVGIVQHIEG	GEQIVEDGIG	MAHTEHVPGT	AENARSCIRA	YFYDLHETLC
RQEEMALSVV	DAHVREKLIW	LRQQQEDMTI	LLSEVSAACL	HCEKTLQQDD
CRVVLAKQEI	TRLLETLQKQ	QQQFTEVADH	IQLDASIPVT	FTKDNRVHIG
PKMEIRVVTL	GLDGAGKTTI	LFKLKQDEFM	QPIPTIGFNV	ETVEYKNLKF
TIWDVGGKHK	LRPLWKHYYL	NTQAVVFVVD	SSHRDRISEA	HSELAKLLTE
KELRDALLLI	FANKQDVAGA	LSVEEITELL	SLHKLCCGRS	WYIQGCDARS
GMGLYEGLDW	LSRQLVAAGV	LDVA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до трансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, убіквітинування білків, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, іонами металів, іоном цинку, ГТФ. Локалізований у мембрані, лізосомі, апараті гольджі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Vitale N., Horiba K., Ferrans V.J., Moss J., Vaughan M. (1998). Localization of ADP-ribosylation factor domain protein 1 (ARD1) in lysosomes and Golgi apparatus. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95: 8613—8618. PMID 9671726 DOI:10.1073/pnas.95.15.8613
Vichi A., Payne D.M., Pacheco-Rodriguez G., Moss J., Vaughan M. (2005). E3 ubiquitin ligase activity of the trifunctional ARD1 (ADP-ribosylation factor domain protein 1). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102: 1945—1950. PMID 15684077 DOI:10.1073/pnas.0409800102
Mishima K., Tsuchiya M., Nightingale M.S., Moss J., Vaughan M. (1993). ARD 1, a 64-kDa guanine nucleotide-binding protein with a carboxyl-terminal ADP-ribosylation factor domain. J. Biol. Chem. 268: 8801—8807. PMID 8473324

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:660 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.
↑ UniProt, P36406 (англ.) . Архів оригіналу за 7 серпня 2017. Процитовано 31 серпня 2017.