MIB1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
4TSE, 4XI6, 4XI7, 4XIB

Ідентифікатори

Символи

MIB1, DIP-1, DIP1, LVNC7, MIB, ZZANK2, ZZZ6, mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 1, MIB E3 ubiquitin protein ligase 1

Зовнішні ІД

OMIM: 608677 MGI: 2443157 HomoloGene: 10810 GeneCards: MIB1

Реагує на сполуку

Viroporin 3a^[1]

Онтологія гена
Молекулярна функція	• zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • transferase activity
Клітинна компонента	• цитоплазма • гіалоплазма • центросома • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • клітинна мембрана • центр організації мікротрубочок • цитоскелет • GO:0016023 cytoplasmic vesicle
Біологічний процес	• somitogenesis • ендоцитоз • negative regulation of neuron differentiation • in utero embryonic development • heart looping • positive regulation of endocytosis • heart development • blood vessel development • Убіквітин-залежний протеоліз • neural tube formation • Сигнальний шлях Notch
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


57534


225164

Ensembl


ENSG00000101752


ENSMUSG00000024294

UniProt


Q86YT6


Q80SY4

RefSeq (мРНК)


NM_020774


NM_144860 NM_001364997

RefSeq (білок)


NP_065825


NP_659109 NP_001351926

Локус (UCSC)

Хр. 18: 21.7 – 21.87 Mb

Хр. 18: 10.73 – 10.82 Mb

PubMed search

^[2]

^[3]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

MIB1 (англ. Mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 006 амінокислот, а молекулярна маса — 110 136^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSNSRNNRVM	VEGVGARVVR	GPDWKWGKQD	GGEGHVGTVR	SFESPEEVVV
VWDNGTAANY	RCSGAYDLRI	LDSAPTGIKH	DGTMCDTCRQ	QPIIGIRWKC
AECTNYDLCT	VCYHGDKHHL	RHRFYRITTP	GSERVLLESR	RKSKKITARG
IFAGARVVRG	VDWQWEDQDG	GNGRRGKVTE	IQDWSASSPH	SAAYVLWDNG
AKNLYRVGFE	GMSDLKCVQD	AKGGSFYRDH	CPVLGEQNGN	RNPGGLQIGD
LVNIDLDLEI	VQSLQHGHGG	WTDGMFETLT	TTGTVCGIDE	DHDIVVQYPS
GNRWTFNPAV	LTKANIVRSG	DAAQGAEGGT	SQFQVGDLVQ	VCYDLERIKL
LQRGHGEWAE	AMLPTLGKVG	RVQQIYSDSD	LKVEVCGTSW	TYNPAAVSKV
ASAGSAISNA	SGERLSQLLK	KLFETQESGD	LNEELVKAAA	NGDVAKVEDL
LKRPDVDVNG	QCAGHTAMQA	ASQNGHVDIL	KLLLKQNVDV	EAEDKDGDRA
VHHAAFGDEG	AVIEVLHRGS	ADLNARNKRR	QTPLHIAVNK	GHLQVVKTLL
DFGCHPSLQD	SEGDTPLHDA	ISKKRDDILA	VLLEAGADVT	ITNNNGFNAL
HHAALRGNPS	AMRVLLSKLP	RPWIVDEKKD	DGYTALHLAA	LNNHVEVAEL
LVHQGNANLD	IQNVNQQTAL	HLAVERQHTQ	IVRLLVRAGA	KLDIQDKDGD
TPLHEALRHH	TLSQLRQLQD	MQDVGKVDAA	WEPSKNTLIM	GLGTQGAEKK
SAASIACFLA	ANGADLSIRN	KKGQSPLDLC	PDPNLCKALA	KCHKEKVSGQ
VGSRSPSMIS	NDSETLEECM	VCSDMKRDTL	FGPCGHIATC	SLCSPRVKKC
LICKEQVQSR	TKIEECVVCS	DKKAAVLFQP	CGHMCACENC	ANLMKKCVQC
RAVVERRVPF	IMCCGGKSSE	DATDDISSGN	IPVLQKDKDN	TNVNADVQKL
QQQLQDIKEQ	TMCPVCLDRL	KNMIFLCGHG	TCQLCGDRMS	ECPICRKAIE
RRILLY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як убіквітинування білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVI. The complete sequences of 150 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 65—73. PMID 10718198 DOI:10.1093/dnares/7.1.65
Li S., Wang L., Berman M., Kong Y.Y., Dorf M.E. (2011). Mapping a dynamic innate immunity protein interaction network regulating type I interferon production. Immunity. 35: 426—440. PMID 21903422 DOI:10.1016/j.immuni.2011.06.014

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21086 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.
↑ UniProt, Q86YT6 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.