EEF1A2

EEF1A2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB

4C0S, 3C5J

Ідентифікатори
Символи EEF1A2, EEF1AL, EF-1-alpha-2, EF1A, HS1, STN, STNL, EIEE33, MRD38, eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 2, DEE33
Зовнішні ІД OMIM: 602959 MGI: 1096317 HomoloGene: 121568 GeneCards: EEF1A2
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 38, undetermined early-onset epileptic encephalopathy[1]
Онтологія гена
Молекулярна функція

nucleotide binding
GTP binding
translation factor activity, RNA binding
GO:0001948, GO:0016582 protein binding
protein kinase binding
GO:0006184 GTPase activity
translation elongation factor activity

Клітинна компонента

myelin sheath
neuronal cell body
cytoplasmic side of lysosomal membrane
клітинне ядро
eukaryotic translation elongation factor 1 complex
цитоплазма
синапс

Біологічний процес

positive regulation of apoptotic process
regulation of chaperone-mediated autophagy
translational elongation
positive regulation of lipid kinase activity
response to electrical stimulus
Біосинтез білків
response to inorganic substance

Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1917
13628
Ensembl
ENSG00000101210
ENSMUSG00000016349
UniProt
Q05639
P62631
RefSeq (мРНК)
NM_001958
NM_007906
RefSeq (білок)
NP_001949
NP_031932
Локус (UCSC) Хр. 20: 63.49 – 63.5 Mb Хр. 2: 180.79 – 180.8 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

EEF1A2 (англ. Eukaryotic translation elongation factor 1 alpha 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 463 амінокислот, а молекулярна маса — 50 470[5].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGKEKTHINIVVIGHVDSGKSTTTGHLIYKCGGIDKRTIEKFEKEAAEMG
KGSFKYAWVLDKLKAERERGITIDISLWKFETTKYYITIIDAPGHRDFIK
NMITGTSQADCAVLIVAAGVGEFEAGISKNGQTREHALLAYTLGVKQLIV
GVNKMDSTEPAYSEKRYDEIVKEVSAYIKKIGYNPATVPFVPISGWHGDN
MLEPSPNMPWFKGWKVERKEGNASGVSLLEALDTILPPTRPTDKPLRLPL
QDVYKIGGIGTVPVGRVETGILRPGMVVTFAPVNITTEVKSVEMHHEALS
EALPGDNVGFNVKNVSVKDIRRGNVCGDSKSDPPQEAAQFTSQVIILNHP
GQISAGYSPVIDCHTAHIACKFAELKEKIDRRSGKKLEDNPKSLKSGDAA
IVEMVPGKPMCVESFSQYPPLGRFAVRDMRQTVAVGVIKNVEKKSGGAGK
VTKSAQKAQKAGK

Кодований геном білок за функцією належить до факторів елонгації. Задіяний у такому біологічному процесі як біосинтез білка. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у ядрі.

Література

  • Knudsen S.M., Frydenberg J., Clark B.F.C., Leffers H. (1993). Tissue-dependent variation in the expression of elongation factor-1 alpha isoforms: isolation and characterisation of a cDNA encoding a novel variant of human elongation-factor 1 alpha. Eur. J. Biochem. 215: 549—554. PMID 8354261 DOI:10.1111/j.1432-1033.1993.tb18064.x
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Lee S., Ann D.K., Wang E. (1994). Cloning of human and mouse brain cDNAs coding for S1, the second member of the mammalian elongation factor-1 alpha gene family: analysis of a possible evolutionary pathway. Biochem. Biophys. Res. Commun. 203: 1371—1377. PMID 7945283 DOI:10.1006/bbrc.1994.2336
  • Dai S., Crawford F., Marrack P., Kappler J.W. (2008). The structure of HLA-DR52c: comparison to other HLA-DRB3 alleles. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105: 11893—11897. PMID 18697946 DOI:10.1073/pnas.0805810105

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з EEF1A2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3192 (англ.) . Архів оригіналу за 28 березня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.
  5. UniProt, Q05639 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2016. Процитовано 6 лютого 2017.

Див. також

  • Хромосома 20

П:  Портал «Біологія» П:  Портал «Хімія»

 
Біосинтез білків: трансляція (трансляція прокаріотів, трансляція еукаріотів)
Білки
Фактори ініціації трансляції
Фактори ініціації трансляції прокаріотів
  • PIF-1
  • PIF-2
  • PIF-3
Фактори ініціації трансляції археїв
  • aIF1
  • aIF2
  • aIF5
  • aIF6
Фактори ініціації трансляції еукаріотів
eIF1
eIF2
eIF3
eIF4
eIF5
eIF6
Фактори елонгації трансляції
Фактори елонгації трансляції прокаріотів
  • EF-Tu
  • EF-Ts
  • EF-G
Фактори елонгації трансляції археїв
  • aEF-1, aEF-2
Фактори елонгації трансляції еукаріотів
Фактори термінації трансляції
  • Фактори термінації трансляції прокаріотів
  • Фактори термінації трансляції археїв
  • Фактори термінації трансляції еукаріотів
Рибосомні білки
Цитоплазмові
підрозділ 60S
підрозділ 40S
Мітохондріальні
підрозділ 39S
підрозділ 28S


Молекула міоглобіну Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.