CXCL11

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1RJT

Ідентифікатори

Символи

CXCL11, H174, I-TAC, IP-9, IP9, SCYB11, SCYB9B, b-R1, C-X-C motif chemokine ligand 11

Зовнішні ІД

OMIM: 604852 HomoloGene: 3944 GeneCards: CXCL11

Онтологія гена
Молекулярна функція	• chemokine activity • cytokine activity • heparin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • CXCR3 chemokine receptor binding
Клітинна компонента	• extracellular region • міжклітинний простір • внутрішньоклітинний
Біологічний процес	• хемотаксис • positive regulation of leukocyte chemotaxis • T cell chemotaxis • chemokine-mediated signaling pathway • response to lipopolysaccharide • cell-cell signaling • positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol • positive regulation of cAMP-mediated signaling • regulation of cell population proliferation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0072468 сигнальна трансдукція • defense response • inflammatory response • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • regulation of signaling receptor activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • adenylate cyclase-activating G protein-coupled receptor signaling pathway • neutrophil chemotaxis • leukocyte chemotaxis • cellular response to lipopolysaccharide
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6373


305236

Ensembl


ENSG00000169248


ENSRNOG00000022298

UniProt


O14625


Q7TNL0

RefSeq (мРНК)


NM_005409 NM_001302123


NM_182952

RefSeq (білок)


NP_001289052 NP_005400


NP_891997

Локус (UCSC)

Хр. 4: 76.03 – 76.04 Mb

н/д

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CXCL11 (англ. C-X-C motif chemokine ligand 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 94 амінокислот, а молекулярна маса — 10 365^[4].

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSVKGMAIAL		AVILCATVVQ		GFPMFKRGRC		LCIGPGVKAV		KVADIEKASI
MYPSNNCDKI		EVIITLKENK		GQRCLNPKSK		QARLIIKKVE		RKNF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у таких біологічних процесах як запальна відповідь, хемотаксис, поліморфізм. Секретований назовні.

Література

Laich A.M., Meyer M., Werner E.R., Werner-Felmayer G. (1999). Structure and expression of the human small cytokine B subfamily member 11 (SCYB11/formerly SCYB9B, alias I-TAC) gene cloned from IFN-gamma-treated human monocytes (THP-1). J. Interferon Cytokine Res. 19: 505—513. PMID 10386863 DOI:10.1089/107999099313956
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Booth V., Clark-Lewis I., Sykes B.D. (2004). NMR structure of CXCR3 binding chemokine CXCL11 (ITAC). Protein Sci. 13: 2022—2028. PMID 15273303 DOI:10.1110/ps.04791404
Erdel M., Laich A., Utermann G., Werner E.R., Werner-Felmayer G. (1998). The human gene encoding SCYB9B, a putative novel CXC chemokine, maps to human chromosome 4q21 like the closely related genes for MIG (SCYB9) and INP10 (SCYB10). Cytogenet. Cell Genet. 81: 271—272. PMID 9730616

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10638 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.
↑ UniProt, O14625 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.