CX3CL1

Наявні структури

Пошук ортологів: PDBe RCSB

Список кодів PDB
1B2T, 1F2L, 3ONA, 4XT1, 4XT3

Ідентифікатори

Символи

CX3CL1, ABCD-3, C3Xkine, CXC3, CXC3C, NTN, NTT, SCYD1, fractalkine, neurotactin, C-X3-C motif chemokine ligand 1

Зовнішні ІД

OMIM: 601880 MGI: 1097153 HomoloGene: 2251 GeneCards: CX3CL1

Онтологія гена
Молекулярна функція	• cytokine activity • chemokine activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • CCR chemokine receptor binding • signaling receptor binding • integrin binding • CX3C chemokine receptor binding
Клітинна компонента	• integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • extracellular region • cell surface • міжклітинний простір
Біологічний процес	• G protein-coupled receptor signaling pathway • defense response • positive regulation of inflammatory response • monocyte chemotaxis • cytokine-mediated signaling pathway • chemokine-mediated signaling pathway • angiogenesis involved in wound healing • cellular response to tumor necrosis factor • Загоєння ран • leukocyte chemotaxis • neutrophil chemotaxis • positive regulation of angiogenesis • positive regulation of transforming growth factor beta1 production • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • адгезія клітин • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • cellular response to interleukin-1 • leukocyte adhesive activation • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • cellular response to interferon-gamma • cell chemotaxis • lymphocyte chemotaxis • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand • positive regulation of calcium-independent cell-cell adhesion • хемотаксис • integrin activation • negative regulation of cell migration • leukocyte migration involved in inflammatory response • macrophage chemotaxis • regulation of signaling receptor activity
Джерела:Amigo / QuickGO

Шаблон експресії

Більше даних

Ортологи

Види

Людина

Миша

Entrez


6376


20312

Ensembl


ENSG00000006210


ENSMUSG00000031778

UniProt


P78423


O35188

RefSeq (мРНК)


NM_002996 NM_001304392


NM_009142

RefSeq (білок)


NP_001291321 NP_002987


NP_033168

Локус (UCSC)

Хр. 16: 57.37 – 57.39 Mb

Хр. 8: 95.5 – 95.51 Mb

PubMed search

^[1]

^[2]

Вікідані

Див./Ред. для людей

Див./Ред. для мишей

CX3CL1 (англ. C-X3-C motif chemokine ligand 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 397 амінокислот, а молекулярна маса — 42 203^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAPISLSWLL	RLATFCHLTV	LLAGQHHGVT	KCNITCSKMT	SKIPVALLIH
YQQNQASCGK	RAIILETRQH	RLFCADPKEQ	WVKDAMQHLD	RQAAALTRNG
GTFEKQIGEV	KPRTTPAAGG	MDESVVLEPE	ATGESSSLEP	TPSSQEAQRA
LGTSPELPTG	VTGSSGTRLP	PTPKAQDGGP	VGTELFRVPP	VSTAATWQSS
APHQPGPSLW	AEAKTSEAPS	TQDPSTQAST	ASSPAPEENA	PSEGQRVWGQ
GQSPRPENSL	EREEMGPVPA	HTDAFQDWGP	GSMAHVSVVP	VSSEGTPSRE
PVASGSWTPK	AEEPIHATMD	PQRLGVLITP	VPDAQAATRR	QAVGLLAFLG
LLFCLGVAMF	TYQSLQGCPR	KMAGEMAEGL	RYIPRSCGSN	SYVLVPV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, хемотаксис. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Halim A., Nilsson J., Ruetschi U., Hesse C., Larson G. (2011). Human urinary glycoproteomics; attachment site specific analysis of N-and O-linked glycosylations by CID and ECD. Mol. Cell. Proteomics: —. PMID 22171320 DOI:10.1074/mcp.M111.013649
Fujita M., Takada Y.K., Takada Y. (2012). Integrins alphavbeta3 and alpha4beta1 act as coreceptors for fractalkine, and the integrin-binding defective mutant of fractalkine is an antagonist of CX3CR1. J. Immunol. 189: 5809—5819. PMID 23125415 DOI:10.4049/jimmunol.1200889
Fujita M., Takada Y.K., Takada Y. (2014). The chemokine fractalkine can activate integrins without CX3CR1 through direct binding to a ligand-binding site distinct from the classical RGD-binding site. PLoS ONE. 9: E96372—E96372. PMID 24789099 DOI:10.1371/journal.pone.0096372
Mizoue L.S., Bazan J.F., Johnson E.C., Handel T.M. (1999). Solution structure and dynamics of the CX3C chemokine domain of fractalkine and its interaction with an N-terminal fragment of CX3CR1. Biochemistry. 38: 1402—1414. PMID 9931005 DOI:10.1021/bi9820614
Hoover D.M., Mizoue L.S., Handel T.M., Lubkowski J. (2000). The crystal structure of the chemokine domain of fractalkine shows a novel quaternary arrangement. J. Biol. Chem. 275: 23187—23193. PMID 10770945 DOI:10.1074/jbc.M002584200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10647 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2016. Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, P78423 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.